Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf72Q96LT7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms