Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM47Q96LD4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms