Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP47Q96K76 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP47Q96K76 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms