Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGBD1Q96JS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms