Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CELF6Q96J87 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms