Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CRELD1Q96HD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRELD1Q96HD1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms