Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCN3Q96D15 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCN3Q96D15 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms