Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OPTNQ96CV9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OPTNQ96CV9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPTNQ96CV9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms