Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35C1Q96A29 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC35C1Q96A29 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms