Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKD2Q969F2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms