Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-CQ95604 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-CQ95604 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms