Protein–RNA interactions for Protein: Q93033

CD101, Immunoglobulin superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD101Q93033 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD101Q93033 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CD101Q93033 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD101Q93033 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD101Q93033 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD101Q93033 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD101Q93033 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD101Q93033 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD101Q93033 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD101Q93033 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD101Q93033 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms