Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA6Q92908 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms