Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RGP1Q92546 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RGP1Q92546 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms