Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3CQ92520 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3CQ92520 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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