Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRIPQ8WXE1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms