Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMO7Q8WWI1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMO7Q8WWI1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms