Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C4orf3Q8WVX3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C4orf3Q8WVX3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms