Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC12Q8WVT3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms