Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
COG1Q8WTW3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG1Q8WTW3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms