Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD1Q8NHV4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms