Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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