Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CARMIL3Q8ND23 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms