Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC44A5Q8NCS7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC44A5Q8NCS7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms