Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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