Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PNLDC1Q8NA58 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNLDC1Q8NA58 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms