Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TC2NQ8N9U0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TC2NQ8N9U0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms