Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AMER3Q8N944 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms