Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CA13Q8N1Q1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CA13Q8N1Q1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms