Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RHOT1Q8IXI2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOT1Q8IXI2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms