Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARID3BQ8IVW6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms