Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A9Q8IVB4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms