Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37DQ86XT2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37DQ86XT2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms