Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LCA5Q86VQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LCA5Q86VQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms