Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALYREFQ86V81 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALYREFQ86V81 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms