Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5H5

VN1R4, Vomeronasal type-1 receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R4Q7Z5H5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VN1R4Q7Z5H5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R4Q7Z5H5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms