Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP2Q7RTS6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOP2Q7RTS6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms