Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TPGS1Q6ZTW0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPGS1Q6ZTW0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms