Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMC5Q6UXY8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMC5Q6UXY8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms