Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM1Q6UX27 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM1Q6UX27 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms