Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF7Q6Q0C0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms