Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LARP1Q6PKG0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms