Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC174Q6PII3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC174Q6PII3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC174Q6PII3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms