Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTR9Q6PD62 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTR9Q6PD62 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms