Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RWDD4Q6NW29 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RWDD4Q6NW29 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms