Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP1Q6NVU6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP1Q6NVU6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms