Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT39Q6A163 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT39Q6A163 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms