Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
INTS3Q68E01 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INTS3Q68E01 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms