Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CARMIL1Q5VZK9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms