Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD4Q5VX71 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD4Q5VX71 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms